MES系統(tǒng)與ERP系統(tǒng)的管理目標(biāo)和使用對象是不同的。MES系統(tǒng)面向車間生產(chǎn)現(xiàn)場，目標(biāo)是提高生產(chǎn)效率與品質(zhì)管控。ERP系統(tǒng)則面向財務(wù)，目標(biāo)是成本核算、資金管控與財務(wù)分析。所以ERP系統(tǒng)的生產(chǎn)管理側(cè)重于財務(wù)需求，現(xiàn)場管理很弱，所以ERP系統(tǒng)普遍不受車間歡迎。

實際上，MES系統(tǒng)與ERP系統(tǒng)是上下游的配合關(guān)系，ERP系統(tǒng)制定計劃，MES系統(tǒng)負(fù)責(zé)執(zhí)行，并把執(zhí)行結(jié)果返回ERP系統(tǒng)，形成計劃與執(zhí)行的管理閉環(huán)才是最佳的管理模式。所以，大部分情況下上線MES系統(tǒng)管生產(chǎn)比購買ERP系統(tǒng)生產(chǎn)模塊效果更好。